Vezikoüreteral reflü (VUR) çocuklarda oldukça sık görülen ürolojik hastalıklardandır. Tüm çocukların yaklaşık olarak %1-2'sindeve akut piyelonefrit geçiren çocukların ise %30 kadarında reflü vardır. Yenidoğanlarda reflü sıklığı erkeklerde daha sık iken, daha ileriki yaşlarda kız çocuklarında 5 kat daha sık gözlenir. Mesanedeki idrarın, normalde olmaması gereken biçimde, üreter ve/ya böbreğin toplayıcı sistemine kaçmasıdır. Primer olarak izlendiğinde sebep üreter-mesane bileşkesindeki yapısal bozukluktan, sekonder olarak izlendiğinde ise, anatomik yada fonksiyonel mesane çıkım obstrüksiyonundan dolayı oluşmaktadır. Semptomları olan reflülü çocukların yarısına yakın kısmında radyolojik olarak renal skar bulgusu vardır ve bu da enfeksiyon sonrası böbrek hasarı ile birlikte doğuştan kaynaklanan bozulmalara bağlıdır.

Erkek çocuklarda en sık görülen dış genital sistem anomalilerinden birisi olan kriptorşidizm (inmemiş testis), 1 yaşını doldurmuş 100 erkek çocuktan birisini etkilemektedir. Testislerden birisi ya da her ikisinin birden skrotumda ele gelmemesidir. Çoğunlukla anne-babanın ya da çocuk doktorunun fark etmesi sonucu başvurmaktadırlar. İnmemiş testisi genellikle palpe edilebilen (ele gelen) ve palpe edilemeyen diye sınıflandırmaktayız. Ele gelen testisler çoğunlukla kasık bölgesinde iken, ele gelmeyen testisler bazen kasık bölgesinde bazen bu bölgenin dışında ve bazen de karın içinde olabilmektedir. İki taraflı palpe edilemeyen testis söz konusu ve beraberinde hipospadias gibi seksüel farklılaşma problemi şüphesi var ise acil olarak endokrinolojik ve genetik değerlendirme gereklidir.

Hipospadias penisin alt kısmını oluşturan dokuların tam olarak gelişememesi sonucu üretra deliğinin penis ucundan daha alt bir bölgeye açılması ve bu bölümde sünnet derisinin eksikliğidir. İdrar deliği penis ucuna yakın olabildiği gibi penis ortasına, hatta penis köküne de açılabilir. Halk arasında yarım sünnetli olma da denilen hipospadiyasa endokrin hastalıklar, annenin yaşının çok genç yada ileri olması, düşük doğum ağırlığı ve ikiz doğum durumlarında daha sık rastlanılmaktadır. Son 30 yılda hipospadias görülme sıklığının daha da artması, sebepler arasında çevresel faktörlerin de rol oynadığını düşündürmüştür. Tanı doğuşta koulmalıdır, ancak ülkemizde halen bu konuda yeterli bilinç oluşmamıştır.